La salud es un eje prioritario para el gobierno de Tlaxcala, a pesar de estar en semáforo amarillo, debemos mantener las medidas sanitarias para evitar contagios del virus SARS-CoV-2, por ello la Secretaría de Salud (SESA) exhorta a la población seguir con el uso de cubrebocas, lavado constante de manos y mantener la sana distancia, en caso de detectar síntomas del virus, comunicarse de manera inmediata al 911. “Si te cuidas tú, nos cuidamos todos”.
Los datos de la SESA registrados en la plataforma nacional del Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Enfermedades Respiratorias (Sisver), confirmaron 28 casos positivos de Covid-19 y tres defunciones el 13 de octubre de 2021. 
Con corte a esta fecha, se han acumulado 26 mil 310 casos positivos, 60 mil 754 negativos, 21 mil 957 recuperados, dos mil 769 defunciones y mil 686 casos sospechosos.
De los 26 mil 310 casos positivos, dos mil 416 se han registrado en el Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Estado (Issste), mil 819 en otras instituciones, 12 mil 820 en el Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) y nueve mil 255 en la SESA.
Hasta este momento, el municipio de Tlaxcala registra cuatro mil 543 casos confirmados, Apizaco tres mil ocho, Chiautempan mil 625, Huamantla mil 418, Zacatelco mil 303, Yauhquemehcan 926, San Pablo del Monte 930, Contla de Juan Cuamatzi 721, Papalotla de Xicohténcatl 710, Tetla de la Solidaridad 672, Ixtacuixtla 660, Calpulalpan 606, Teolocholco 597, Totolac 571, Tlaxco 584.
Panotla 552, Apetatitlán 469, Santa Cruz Tlaxcala 433, Xaloztoc 436, Tzompantepec 397, Nativitas 338, Tepeyanco 312, Xicohtzinco 322, Tepetitla de Lardizábal 298, Amaxac de Guerrero 258, La Magdalena Tlaltelulco 247, Tenancingo 195, Xaltocan 185, Nanacamilpa 210, Tetlatlahuca 177.
Santa Catarina Ayometla 167, San Francisco Tetlanohcan 149, Ixtenco 144, Terrenate 129, Hueyotlipan 122, Tocatlán 136, Acuamanala 123, San Lorenzo Axocomanitla 115, Santa Ana Nopalucan 107, El Carmen Tequexquitla 110, Cuapiaxtla 108, Cuaxomulco 112, San Juan Huactzinco 102, San Jerónimo Zacualpan 82, Atltzayanca 77.
Santa Isabel Xiloxoxtla 74, Zitlaltepec 73, San Damián Texoloc 68, San José Teacalco 72, Atlangatepec 72, Santa Apolonia Teacalco 65, Sanctórum 57, Mazatecochco 53, Lázaro Cárdenas 58, Muñoz de Domingo Arenas 51, Santa Cruz Quilehtla 50, Españita 47, San Lucas Tecopilco 35, Benito Juárez 30 y Emiliano Zapata 18, datos acumulados en lo que va de la pandemia de 2020 al miércoles 13 de octubre de 2021.